Het Werkhuis werd in 1609 op het terrein van het verbrande Pesthuis in de Tuchthuisstraat gebouwd. In 1679 zijn in het Tucht- of Werkhuis ook armen ondergebracht. Het gesticht kwam, onder de naam van Aalmoezeniers Armen- en Werkhuis, onder beheer van de Regenten van de Schaal- of Aalmoezeniers, die tot dusver alleen de thuiszittende armen verzorgden. In 1786 zijn de armen hieruit overgebracht naar het in 1768 nieuw gebouwde Diaconiehuis van de Nederlands Hervormde Gemeente op de Koudenhorn; het werd toen gemeenschappelijk beheerd door Aalmoezeniers en Diakenen, die ook thuiszittende armen bedeelden. In 1826 bleef dit gesticht, sinds 1810 gevestigd in de Magdalenastraat, onder bestuur van Regenten, terwijl de Diakenen voortaan belast werden met de thuiszittende armen. In 1856 heeft de Hervormde Gemeente een eigen Diaconiehuis opgericht in de Jansstraat. De armen uit het oude gesticht, dat opgeheven werd, zijn ten dele hierheen overgebracht, ten dele naar het Stads Armen- en Ziekenhuis aan de Schotersingel. Het huis in de Tuchthuisstraat werd in 1824 Huis voor arrest, en werd in 1907 afgebroken. Het archief van de Verenigde Diaconie- en Aalmoezeniersarmenhuis is als deelarchief van het archief van de Diakonie van de Nederlands Hervormde Gemeente beschreven.